Lo mejor es mezclar 3 tipos de anuncios en la misma página.

En la parte superior de la web puedes colocar un banner de 728x90.  Puedes fijarte que casi todas las páginas tienen un banner de ese tamaño   en ese apartado de la web.

Luego, a mitad de la página, junto al contenido, puedes colocar un banner de 300x250. Este tipo de banner son muy rentables, y al colocarlos junto al texto de la web, ganaras muchos clicks extras.

Luego, a los lados de la página puedes colocar un banner de 160x600. Este formato no molesta mucho a la navegación en la página, y pueden proporcionarte varios clicks fácilmente.

También hay otros tipos de formato para la publicidad, pero esos son los que suelen llevar todas las páginas, y los más rentables.